Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CXCL13O43927 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CXCL13O43927 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms