Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP9BO43861 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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