Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYTH3O43739 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYTH3O43739 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms