Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXA3O43365 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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HOXA3O43365 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA3O43365 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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