Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CRXO43186 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CRXO43186 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRXO43186 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRXO43186 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms