Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVH48-1M5A8F1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVH48-1M5A8F1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms