Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLDN34H7C241 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms