Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L13C9JLJ4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms