Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRDCB7Z8K6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRDCB7Z8K6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms