Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DEV8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DEV8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DEV8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DEV8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DEV8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DEV8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DEV8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DEV8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DEV8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DEV8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DEV8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DEV8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DEV8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
B4DEV8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms