Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM1B2RUZ4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SMIM1B2RUZ4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms