Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GOLGA6L9A6NEM1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L9A6NEM1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms