Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2F8A0AVK6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2F8A0AVK6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms