Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091810.1-201ENST00000603131 325 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR7847-201ENST00000610912 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4290HG-201ENST00000426593 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PAQR5-205ENST00000561153 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG1-205ENST00000392382 2690 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ST5-213ENST00000526757 3019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CAB39L-201ENST00000347776 3361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031846.2-201ENST00000624656 3671 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC126323.1-203ENST00000562306 2579 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PLA2G2C-202ENST00000429261 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGB6-201ENST00000520790 4599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HIPK1-203ENST00000369553 2883 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EFHC1-214ENST00000636107 3530 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG13-204ENST00000436609 3812 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 APOBEC3C-201ENST00000361441 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MPP4-202ENST00000359962 2436 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A44-202ENST00000423538 3662 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092135.1-201ENST00000623398 2059 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms