Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms