Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC091940.1-204ENST00000507318 3091 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 PSMC1P7-201ENST00000495689 1315 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 SNRNP40-202ENST00000373720 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 SSX9-201ENST00000376909 591 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AL354732.1-204ENST00000421020 755 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 LINC01206-228ENST00000628718 871 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC024337.1-201ENST00000558860 1562 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 ARMC3-201ENST00000298032 2811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 ZNF540-202ENST00000343599 3073 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 TNS4-201ENST00000254051 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 PAX8-AS1-201ENST00000333145 2319 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 AC114324.1-201ENST00000504077 3152 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 ZNF234-201ENST00000426739 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 C1orf131-203ENST00000366651 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 MLANA-203ENST00000381477 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
C4orf17Q53FE4 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms