Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MTHFD1-201ENST00000216605 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PKMP2-201ENST00000412159 1677 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD20A5P-201ENST00000431648 3556 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TULP3-202ENST00000448120 3076 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005865.1-201ENST00000432994 3004 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIK1-205ENST00000399909 3427 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 ICE2-213ENST00000561114 3796 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KRTAP4-12Q9BQ66 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 HIVEP1-209ENST00000627968 8924 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA4G-202ENST00000370250 3596 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD20A3-201ENST00000611388 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 AL445933.1-201ENST00000434240 2242 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
KRTAP4-12Q9BQ66 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms