Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 GRHL1-206ENST00000480736 572 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 PGAM1P9-201ENST00000503887 755 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 LINC00499-204ENST00000515282 579 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC109630.1-201ENST00000558846 730 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC093249.3-201ENST00000562444 424 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RN7SL123P-201ENST00000577239 292 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 HMGN2P46-208ENST00000598619 490 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL391807.1-201ENST00000603261 712 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.132-201ENST00000619251 285 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RPGR-202ENST00000339363 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CYB5D1-201ENST00000332439 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 KIF23-202ENST00000352331 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ZSCAN32-201ENST00000304926 3027 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 LINC00484-205ENST00000423719 3023 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ZNF763-201ENST00000343949 2621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SCAF11-202ENST00000369367 7543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ATF2-206ENST00000409635 2109 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 EFHC1-226ENST00000636954 2129 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 GSK3A-202ENST00000398249 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 PDPN-201ENST00000294489 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AMPH-201ENST00000325590 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SCRN1-201ENST00000242059 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 BDNF-216ENST00000532997 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SRGAP2B-204ENST00000612199 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 PAX6-259ENST00000639916 2622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TENM2-205ENST00000519204 9427 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ZNF80-202ENST00000482457 2471 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SEC24A-202ENST00000398844 6299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 UBLCP1-201ENST00000296786 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 GABRA1-203ENST00000428797 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TMEM161B-205ENST00000506536 2328 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MRNIP-204ENST00000518219 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 STAT2-210ENST00000557235 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 KALRN-201ENST00000240874 6537 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 KALRN-211ENST00000460856 6509 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 HKR1-213ENST00000589392 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC092279.2-201ENST00000623742 2189 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ZNF702P-201ENST00000270443 2990 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC023137.1-201ENST00000448241 308 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RN7SL554P-201ENST00000468197 292 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 LINC01948-201ENST00000506836 656 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC022639.1-201ENST00000523191 573 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TP53TG3HP-201ENST00000563487 346 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 TBC1D29-201ENST00000579181 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC141557.2-201ENST00000621330 482 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC009093.6-201ENST00000622268 553 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CU638689.2-201ENST00000623809 818 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 OR7A2P-202ENST00000641312 1219 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ERC1-213ENST00000543086 9241 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 GIGYF2-203ENST00000409451 5937 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AC007920.2-201ENST00000636210 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ADGRE2-201ENST00000315576 6767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 AL049646.1-201ENST00000457009 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 ZFP42-202ENST00000509524 2480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
MKRN4PQ13434 SCRN1-206ENST00000426154 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms