Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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COL24A1Q17RW2 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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COL24A1Q17RW2 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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COL24A1Q17RW2 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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COL24A1Q17RW2 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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COL24A1Q17RW2 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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COL24A1Q17RW2 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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COL24A1Q17RW2 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 TBC1D30-204ENST00000542120 7433 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
COL24A1Q17RW2 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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