Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AFF2-205ENST00000370460 13746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PDE4DIP-237ENST00000585156 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
HERC1Q15751 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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