Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
SRSF5Q13243 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SRSF5Q13243 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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