Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 CSAG2-201ENST00000535353 237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFFO1Q0D2I5 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
IFFO1Q0D2I5 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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