Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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CHD4Q14839 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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CHD4Q14839 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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CHD4Q14839 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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CHD4Q14839 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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CHD4Q14839 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CHD4Q14839 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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