Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 XIRP2-206ENST00000409728 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL512504.2-201ENST00000445455 1909 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CLK1-201ENST00000321356 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ATP2B1-204ENST00000428670 7032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CTSL3P-201ENST00000354530 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL450124.1-201ENST00000376401 353 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RN7SKP139-201ENST00000410411 293 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC006455.4-201ENST00000418297 528 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PIGX-204ENST00000421265 677 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AP000997.1-201ENST00000424313 479 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC073188.4-201ENST00000450077 528 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 ACP5-208ENST00000590420 301 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 U1.22-201ENST00000605806 164 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 IGKV1OR1-1-201ENST00000613775 347 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AL109954.1-201ENST00000619495 557 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 HEATR4-202ENST00000553558 3523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 OR7E11P-202ENST00000642027 1491 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 NLRP3-206ENST00000391828 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 RFX5-201ENST00000290524 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CLN3Q13286 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms