Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MAP3K4Q9Y6R4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MAP3K4Q9Y6R4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms