Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A4Q9Y6R1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A4Q9Y6R1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms