Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms