Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13BQ9Y275 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms