Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTF2Q9UNY4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTF2Q9UNY4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms