Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG6

CCPG1, Cell cycle progression protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCPG1Q9ULG6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCPG1Q9ULG6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCPG1Q9ULG6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms