Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAPPC2LQ9UL33 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms