Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO3Q9UK99 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO3Q9UK99 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms