Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCNL1Q9UK58 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNL1Q9UK58 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms