Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPA4Q9UI42 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPA4Q9UI42 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms