Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUF60Q9UHX1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUF60Q9UHX1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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