Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP25Q9UHP3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP25Q9UHP3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms