Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GTF2IRD1Q9UHL9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2IRD1Q9UHL9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms