Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CHPF2Q9P2E5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHPF2Q9P2E5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms