Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC88CQ9P219 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms