Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAPAQ9P0L0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAPAQ9P0L0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms