Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA13Q9P0J0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFA13Q9P0J0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms