Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC5A4Q9NY91 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms