Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SMC4Q9NTJ3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMC4Q9NTJ3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms