Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCC13Q9NSE7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms