Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAPOLBQ9NRJ5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAPOLBQ9NRJ5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms