Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM12Q9H4Q4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRDM12Q9H4Q4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms