Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL4Q9C0H6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms