Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT23Q9C075 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms