Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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