Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPCDR1Q9BY65 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms